Чингиз Мустафаев родился 29 августа 1960 года во Владимировском районе Астраханской области. В 1964 году переехал вместе с семьёй в Баку. Первоначально учился в Военном лицее имени Джамшида Нахичеванского. После окончания средней школы № 167 Ясамальского района Чингиз поступил в Азербайджанский медицинский институт. Окончил университет в 1983 году, три года работал врачом в Дивичинском районе, а после – главным врачом санатория при Азербайджанском инженерно-строительном институте.
Помимо работы, Мустафаев был поклонником искусства, музыки, журналистики. Интерес к журналистскому расследованию оказался сильнее. И в октябре 1991 года Чингиз создал студию «215 КЛ», при помощи которой привнёс новое в азербайджанское телевидение, а он сам превратился в любимца публики.
С началом боевых действий в Нагорном Карабахе Чингиз полностью посвятил себя военной журналистике.